More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0812 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
317 aa  610  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
317 aa  610  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  60.86 
 
 
317 aa  358  9e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  41.36 
 
 
324 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  44.08 
 
 
350 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 
315 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  42.53 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
314 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.16 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.85 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  42.21 
 
 
327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.46 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  43.97 
 
 
309 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  40 
 
 
329 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.47 
 
 
330 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.47 
 
 
330 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.53 
 
 
327 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 
330 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
311 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  41.99 
 
 
328 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
322 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
311 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  44.01 
 
 
327 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
311 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  41.67 
 
 
311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.88 
 
 
324 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  42.59 
 
 
325 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  41.75 
 
 
322 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  41.35 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.35 
 
 
311 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  41.35 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  41.35 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 
355 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  37.65 
 
 
355 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  39.94 
 
 
334 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
345 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  38.39 
 
 
314 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  46.02 
 
 
319 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  43.18 
 
 
310 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 
306 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  42.03 
 
 
324 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  42.7 
 
 
324 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  42.63 
 
 
324 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.47 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.9 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
334 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
334 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  41.02 
 
 
324 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  43.14 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.88 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.19 
 
 
346 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 
309 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.37 
 
 
334 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.29 
 
 
333 aa  199  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
320 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 
835 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.96 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  39.38 
 
 
341 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  43.58 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.57 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  41.28 
 
 
339 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.56 
 
 
333 aa  195  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.61 
 
 
323 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  39.6 
 
 
318 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  38.64 
 
 
315 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  41.07 
 
 
328 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 
353 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
313 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 
353 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  41.33 
 
 
326 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.56 
 
 
334 aa  192  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  39.88 
 
 
354 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.56 
 
 
342 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
343 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 
347 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
343 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
342 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 
346 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  40.12 
 
 
337 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 
346 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
350 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  42.31 
 
 
333 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  40.38 
 
 
314 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  40.18 
 
 
354 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
342 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
338 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  39.81 
 
 
334 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>