265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0708 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
286 aa  592  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0732  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  98.95 
 
 
286 aa  587  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1053  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.19 
 
 
289 aa  451  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0252049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0633  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.28 
 
 
283 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0792237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1091  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.34 
 
 
287 aa  407  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.43 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.59 
 
 
292 aa  394  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.59 
 
 
291 aa  394  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.59 
 
 
291 aa  394  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.58 
 
 
290 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
291 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.58 
 
 
291 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.86 
 
 
292 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.46 
 
 
290 aa  388  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
310 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.52 
 
 
292 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.26 
 
 
297 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  61.73 
 
 
301 aa  384  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.27 
 
 
294 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
325 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1588  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.44 
 
 
282 aa  384  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.05 
 
 
298 aa  384  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.18 
 
 
295 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.18 
 
 
292 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0693  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.76 
 
 
304 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.11795  hitchhiker  0.0000246007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64 
 
 
290 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.55 
 
 
289 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.18 
 
 
290 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.72 
 
 
315 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.4 
 
 
318 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.25 
 
 
317 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
291 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.45 
 
 
291 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.87 
 
 
295 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.45 
 
 
319 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.18 
 
 
300 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.94 
 
 
299 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.18 
 
 
290 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.04 
 
 
321 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.25 
 
 
329 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
290 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4336  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
294 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.37 
 
 
308 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.18 
 
 
292 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000472181  hitchhiker  0.000000000290022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.02 
 
 
315 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.75 
 
 
294 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.35 
 
 
312 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.25 
 
 
350 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.82 
 
 
301 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.98 
 
 
318 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.37 
 
 
296 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.54 
 
 
317 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.37 
 
 
315 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.51 
 
 
296 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.37 
 
 
364 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.05 
 
 
314 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.82 
 
 
308 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1302  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.65 
 
 
287 aa  371  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.476364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
309 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.98 
 
 
315 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3371  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  61.75 
 
 
333 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00416718  normal  0.205184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.36 
 
 
327 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0778  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.73 
 
 
290 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.9 
 
 
314 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16221  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
290 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0239928  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
301 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.81 
 
 
323 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
317 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60 
 
 
293 aa  371  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.32 
 
 
295 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
317 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.63 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.14 
 
 
303 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.63 
 
 
335 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.79 
 
 
308 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
317 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.63 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.63 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.29 
 
 
287 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
318 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  61.01 
 
 
308 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.3 
 
 
294 aa  368  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.65 
 
 
303 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.63 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.93 
 
 
289 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.68 
 
 
282 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.29 
 
 
294 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.37 
 
 
319 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0804  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.93 
 
 
287 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.93 
 
 
291 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.37 
 
 
319 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.01 
 
 
312 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.57 
 
 
301 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.35 
 
 
317 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.65 
 
 
306 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1047  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.43 
 
 
285 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.01 
 
 
289 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.45 
 
 
304 aa  363  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
296 aa  363  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.01 
 
 
309 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>