More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0670 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  5.43524e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.85556e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  71.92 
 
 
147 aa  225  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  67.79 
 
 
149 aa  222  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  62.07 
 
 
150 aa  195  2e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  60.28 
 
 
155 aa  184  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.43962e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  65.65 
 
 
153 aa  183  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  61.38 
 
 
152 aa  180  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  60.71 
 
 
153 aa  179  8e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  61.43 
 
 
155 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  63.01 
 
 
158 aa  178  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.43287e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  60 
 
 
159 aa  177  6e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
157 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  57.53 
 
 
150 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  58.16 
 
 
161 aa  173  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  53.69 
 
 
161 aa  173  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.14855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  59.29 
 
 
159 aa  172  2e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  59.29 
 
 
155 aa  171  3e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.70079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  57.86 
 
 
159 aa  171  3e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
156 aa  171  4e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.06723e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
155 aa  171  4e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.05152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
156 aa  170  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  54.48 
 
 
158 aa  170  7e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  58.57 
 
 
162 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
157 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
161 aa  168  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  55.4 
 
 
158 aa  168  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  55.94 
 
 
159 aa  167  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  56.43 
 
 
155 aa  167  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
156 aa  166  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  53.74 
 
 
155 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  54.48 
 
 
159 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  52 
 
 
155 aa  165  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  52.41 
 
 
153 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  56.43 
 
 
157 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
155 aa  165  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  54.68 
 
 
158 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
160 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
155 aa  165  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  54.68 
 
 
157 aa  164  3e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
151 aa  164  3e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  54.68 
 
 
157 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
155 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
162 aa  164  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  60.9 
 
 
154 aa  163  7e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
159 aa  163  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  55.86 
 
 
154 aa  163  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
154 aa  162  1e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  52.41 
 
 
172 aa  162  1e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  52.86 
 
 
145 aa  162  1e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  54.36 
 
 
160 aa  162  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  56.55 
 
 
160 aa  162  1e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  54.05 
 
 
160 aa  162  1e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  55 
 
 
155 aa  162  2e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
157 aa  161  2e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  55.71 
 
 
159 aa  162  2e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  55 
 
 
155 aa  162  2e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  52.14 
 
 
168 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  52.14 
 
 
168 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  52.14 
 
 
168 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  55.4 
 
 
158 aa  160  4e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  54.29 
 
 
155 aa  160  5e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  54.29 
 
 
155 aa  160  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  55.78 
 
 
158 aa  160  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
155 aa  160  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  54.11 
 
 
158 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  51.8 
 
 
165 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  56.46 
 
 
158 aa  160  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  53.79 
 
 
160 aa  159  8e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
161 aa  160  8e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  53.57 
 
 
155 aa  159  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  5.70818e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  53.57 
 
 
155 aa  159  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.61916e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  53.57 
 
 
155 aa  159  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.44098e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  53.57 
 
 
155 aa  159  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  53.57 
 
 
155 aa  159  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.21328e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  52.14 
 
 
165 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  51.08 
 
 
157 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  54.68 
 
 
159 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
152 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  54.68 
 
 
154 aa  158  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  55.17 
 
 
151 aa  158  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  53.96 
 
 
159 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  54.35 
 
 
158 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
155 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
167 aa  158  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
155 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  51.03 
 
 
155 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  54.23 
 
 
158 aa  158  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  51.08 
 
 
157 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  53.96 
 
 
158 aa  158  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  52.41 
 
 
154 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.19247e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  55.32 
 
 
150 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.70623e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
154 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  51.8 
 
 
157 aa  157  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  53.64 
 
 
154 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.21346e-10  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
154 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  52.86 
 
 
161 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  52.21 
 
 
153 aa  157  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  52.67 
 
 
154 aa  156  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  48.67 
 
 
155 aa  156  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>