46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0664 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  93.24 
 
 
222 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  37.56 
 
 
223 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  35.81 
 
 
224 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  28.32 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  26.35 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  26.6 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  26.74 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  26.74 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  25.75 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  25.63 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  26.74 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  25.58 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  25.12 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  26.79 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  23.39 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  26.39 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  25.6 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  26.23 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  24.23 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  24.23 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  24.23 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  24.55 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  22.22 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  24.43 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  24.74 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  23 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  23 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  23.2 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  23 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  23 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  21.64 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  23.53 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  21.43 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  22.94 
 
 
223 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  21.95 
 
 
226 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  23.81 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  23.47 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  23.64 
 
 
226 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  21.39 
 
 
224 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  20.93 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  19.7 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  20.47 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  20.24 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  19 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  23.83 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>