45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0641 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  91.09 
 
 		 258 aa  480  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  48.44 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  50.64 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  45.83 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  48.26 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  44.4 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  39.34 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  38.28 
 
 		 848 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  35.16 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  38.52 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  40.09 
 
 		 804 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 1143 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  32.3 
 
 		 1121 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  32.55 
 
 		 1112 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 		 1121 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 		 1121 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  34.1 
 
 		 703 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  31.66 
 
 		 1174 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 767 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.96 
 
 		 739 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.19 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  26.09 
 
 		 313 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.15 
 
 		 846 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  27.54 
 
 		 739 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  24.24 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 1013 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  24.63 
 
 		 741 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  24.63 
 
 		 741 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  25.12 
 
 		 741 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.8 
 
 		 864 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  24.71 
 
 		 1035 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  31.07 
 
 		 531 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  24.68 
 
 		 471 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.76 
 
 		 757 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25.39 
 
 		 1306 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  26.32 
 
 		 429 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.92 
 
 		 6678 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1931 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  23.21 
 
 		 1310 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  25.65 
 
 		 4761 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.92 
 
 		 11716 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1367 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.58 
 
 		 3507 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  27.91 
 
 		 4357 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>