42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0640 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  92.8 
 
 
250 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  41.67 
 
 
250 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  42.44 
 
 
250 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  37.79 
 
 
258 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  38.52 
 
 
258 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  35.8 
 
 
247 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  35.8 
 
 
251 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  35.8 
 
 
247 aa  141  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  34.78 
 
 
249 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  35.71 
 
 
848 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  34.96 
 
 
703 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 
1121 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
1121 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  35.29 
 
 
1121 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  35.62 
 
 
804 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 
1112 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  35.12 
 
 
1143 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  33.33 
 
 
1174 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.19 
 
 
4357 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  28.57 
 
 
1310 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.96 
 
 
846 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.28 
 
 
739 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  29.23 
 
 
739 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  27.91 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  28.99 
 
 
1013 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  27.95 
 
 
757 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.22 
 
 
236 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.27 
 
 
1035 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  38.75 
 
 
3507 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  28.74 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  37.8 
 
 
4433 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  25.11 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  23.56 
 
 
865 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.18 
 
 
11716 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25.66 
 
 
6678 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  32.26 
 
 
4761 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  24.68 
 
 
471 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3234  hypothetical protein  30.68 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  30.86 
 
 
531 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  38.18 
 
 
1597 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4454  hypothetical protein  24.9 
 
 
280 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000148618  normal  0.54702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>