46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0638 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  94.8 
 
 		 250 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  50.61 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  51.01 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  48.44 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  47.71 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  38.8 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  41.98 
 
 		 848 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  41.67 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  40.91 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  39.46 
 
 		 1143 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  39.01 
 
 		 1112 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  37.99 
 
 		 1121 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  37.12 
 
 		 1121 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  37.55 
 
 		 1121 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  41.36 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  40.09 
 
 		 804 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  36.16 
 
 		 1174 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  33.61 
 
 		 703 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.18 
 
 		 4761 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.97 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.49 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4454  hypothetical protein  25.47 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000148618  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25.94 
 
 		 1306 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  24.9 
 
 		 471 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.31 
 
 		 739 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  23.5 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  28.44 
 
 		 739 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.39 
 
 		 599 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  24.52 
 
 		 1035 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  23.68 
 
 		 1310 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.04 
 
 		 6678 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 757 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  26.54 
 
 		 564 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1367 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  29 
 
 		 531 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.29 
 
 		 288 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 594 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 11716 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  25.1 
 
 		 429 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1633  hypothetical protein  25.13 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.14 
 
 		 4433 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  39.53 
 
 		 3507 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.24 
 
 		 1013 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.82 
 
 		 4357 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.57 
 
 		 1967 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>