137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0637 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
471 aa  973    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  69.39 
 
 
475 aa  677    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  93.21 
 
 
471 aa  923    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  70.09 
 
 
476 aa  669    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  55.26 
 
 
707 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  45.28 
 
 
789 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.81 
 
 
810 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  44.95 
 
 
1121 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  44.28 
 
 
1121 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  44.73 
 
 
1121 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  43.42 
 
 
488 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 
1112 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  43.42 
 
 
494 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  43.22 
 
 
804 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  43.32 
 
 
703 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  41.72 
 
 
1143 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  38.76 
 
 
848 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  37.67 
 
 
1174 aa  333  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  33.33 
 
 
531 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  30.48 
 
 
472 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  32.88 
 
 
581 aa  170  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 
456 aa  123  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.26 
 
 
355 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.52 
 
 
355 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  28.66 
 
 
315 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  32 
 
 
331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.26 
 
 
356 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.61 
 
 
352 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.07 
 
 
357 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.57 
 
 
327 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.3 
 
 
346 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.51 
 
 
343 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.58 
 
 
341 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  31.66 
 
 
598 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.95 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.35 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.24 
 
 
319 aa  90.5  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.68 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.3 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  28.88 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 
537 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 
503 aa  73.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.93 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.74 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.97 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  23.4 
 
 
509 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  24.48 
 
 
553 aa  63.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
512 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.74 
 
 
532 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.48 
 
 
306 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
345 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 
495 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  22.91 
 
 
323 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 
480 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26 
 
 
324 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.1 
 
 
829 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  23.05 
 
 
497 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  37.04 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.87 
 
 
401 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.01 
 
 
524 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
514 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 
304 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.48 
 
 
536 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 
540 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.72 
 
 
497 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  27.85 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.1 
 
 
547 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.95 
 
 
550 aa  53.5  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.44 
 
 
522 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  23.79 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  24.13 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25.98 
 
 
699 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 
644 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.02 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 
519 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.59 
 
 
523 aa  51.2  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 
498 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.66 
 
 
540 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 
465 aa  50.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  22.86 
 
 
552 aa  50.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.21 
 
 
546 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.74 
 
 
537 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 
337 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 
369 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  27.83 
 
 
320 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.98 
 
 
536 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.71 
 
 
559 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 
636 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  22.76 
 
 
539 aa  50.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  24.32 
 
 
541 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  28.12 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 
487 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  26.32 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  31.09 
 
 
527 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>