70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0596 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0610  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 
159 aa  320  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0596  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 
159 aa  320  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000617065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1773  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  51.92 
 
 
159 aa  156  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3259  hypothetical protein  45.65 
 
 
162 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226697  normal  0.438812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  43.15 
 
 
152 aa  140  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0040  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.33 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0423  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.56 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1870  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0449  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.91 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3955  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.34 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.948597  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0089  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.11 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1743  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.67 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1318  C4-dicarboxylate transport system, small subunit  23.84 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000464953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2685  TrapT dctQ-M fusion permease, dicarboxylate transport  29.1 
 
 
627 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0344722  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.45 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0034  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.03 
 
 
627 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1382  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.36 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000585397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.83 
 
 
161 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6903  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.15 
 
 
625 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4095  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  26.09 
 
 
628 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0585194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.43 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.1 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  28.3 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4431  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0760  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.6 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0299127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2721  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.36 
 
 
627 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250068  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4386  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.1 
 
 
628 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2369  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.23 
 
 
628 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193075  normal  0.0167467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2094  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.23 
 
 
628 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386051  normal  0.0954493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2444  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.64 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6142  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  24.44 
 
 
619 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0560  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  29.03 
 
 
625 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1794  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.16 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3385  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.77 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3006  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  22.37 
 
 
630 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2741  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.27 
 
 
626 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359375  normal  0.0328397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0263  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  25.41 
 
 
624 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1549  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component-like  26.21 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0554  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.33 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.29193  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  22.4 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07670  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  21.95 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.68 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3120  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.05 
 
 
627 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7228  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.68 
 
 
628 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2482  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.36 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342884  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3644  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  24.59 
 
 
620 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.173742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3763  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.62 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.29 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4815  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  24.72 
 
 
616 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.961579  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  18.12 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.57 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3543  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.22 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.186116  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.36 
 
 
193 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5907  dicarboxylate transporter  27.27 
 
 
210 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68280  dicarboxylate transporter  27.27 
 
 
210 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.408841  normal  0.10811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3446  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.88 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.82702  normal  0.0799989 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1612  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.84 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000153615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0619  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.94 
 
 
182 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1090  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.61 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0890905  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0720  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  20.17 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3271  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  23.33 
 
 
619 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373435  normal  0.294977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1518  putative C4-dicarboxylate transport protein DctQ  24.79 
 
 
232 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4858  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.77 
 
 
205 aa  40.8  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0822  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  23.26 
 
 
628 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  20.66 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4195  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.43 
 
 
176 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>