160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0582 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
567 aa  1169    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
567 aa  1169    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  67.26 
 
 
554 aa  803    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  61.86 
 
 
568 aa  738    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  49.05 
 
 
639 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  48.93 
 
 
642 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  48.5 
 
 
571 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  47.42 
 
 
662 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  47.54 
 
 
583 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  46.91 
 
 
662 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  47.89 
 
 
603 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  51.5 
 
 
598 aa  538  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  47.2 
 
 
685 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  45.66 
 
 
683 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
605 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  45.29 
 
 
625 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  47.78 
 
 
622 aa  525  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  46.86 
 
 
640 aa  524  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  45.44 
 
 
623 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  46.62 
 
 
598 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  46.81 
 
 
620 aa  519  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  47.55 
 
 
666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  45.73 
 
 
599 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  48.57 
 
 
595 aa  515  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  45.19 
 
 
621 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  46.97 
 
 
607 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  45.09 
 
 
718 aa  505  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  46.22 
 
 
600 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  46.61 
 
 
589 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  46.89 
 
 
605 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 
614 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 
648 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  44.29 
 
 
648 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  44.15 
 
 
658 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  43.21 
 
 
657 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.73 
 
 
646 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 
607 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 
673 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 
648 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 
679 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  41.88 
 
 
674 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  42.22 
 
 
677 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 
678 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  42.88 
 
 
679 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 
688 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 
688 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  42 
 
 
671 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  44.46 
 
 
612 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  41.92 
 
 
707 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  43.5 
 
 
680 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  40.39 
 
 
739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  39.05 
 
 
710 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  40.23 
 
 
739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.19 
 
 
620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  40.39 
 
 
739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  40.71 
 
 
775 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
755 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  40.23 
 
 
739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  40.71 
 
 
787 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 
739 aa  452  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  40.34 
 
 
723 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  40.34 
 
 
723 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  40.1 
 
 
739 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  40.34 
 
 
723 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  40.34 
 
 
723 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  40.34 
 
 
723 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  42.06 
 
 
687 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  40.23 
 
 
739 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  40.23 
 
 
739 aa  452  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  40.23 
 
 
739 aa  452  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  41.15 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  40.2 
 
 
724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  38.42 
 
 
787 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  40.24 
 
 
721 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  38.91 
 
 
781 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  39.76 
 
 
630 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  40.1 
 
 
789 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  38.77 
 
 
791 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  39.74 
 
 
746 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  39.2 
 
 
745 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  38.6 
 
 
790 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2985  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 
771 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3203  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 
752 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.939016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  59.24 
 
 
763 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  57.82 
 
 
757 aa  266  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  57.82 
 
 
747 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  58.29 
 
 
769 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  57.35 
 
 
747 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  57.35 
 
 
767 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  57.82 
 
 
771 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6414  Radical SAM domain protein  55.71 
 
 
766 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  56.87 
 
 
766 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  56.87 
 
 
766 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2734  radical SAM family protein  59.9 
 
 
798 aa  257  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.389809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2437  radical SAM domain-containing protein  58.88 
 
 
792 aa  256  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.491099  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  54.03 
 
 
745 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  54.03 
 
 
745 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4005  radical SAM domain-containing protein  55.92 
 
 
831 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143433  normal  0.395979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2133  radical SAM domain-containing protein  55.33 
 
 
810 aa  253  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2225  Radical SAM domain protein  55.45 
 
 
795 aa  253  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>