More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0564 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  100 
 
 		 401 aa  789    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  100 
 
 		 401 aa  789    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  56.17 
 
 		 403 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  54.11 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  51.87 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  51.5 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  49.5 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  51.12 
 
 		 401 aa  388  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  48.49 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  48.76 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  49.87 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  49.5 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  49.5 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  51.15 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  46.48 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  46.48 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  50 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  54.83 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  47.75 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  50 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  48.1 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 403 aa  365  1e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 403 aa  362  6e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  48.48 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  51.65 
 
 		 407 aa  352  8.999999999999999e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  49.1 
 
 		 418 aa  350  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  48.01 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  49.88 
 
 		 537 aa  349  6e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  48.45 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  47.12 
 
 		 415 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.42 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  50.13 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  50.5 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  49.87 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  48 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  48.74 
 
 		 410 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  47.03 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  48.97 
 
 		 412 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  47.49 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  47.63 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  47.63 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  48.99 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  49 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  47.98 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  47.86 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  47.99 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  47.88 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  44.88 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  45.75 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  46.75 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.39 
 
 		 399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  44.08 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  45.71 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  45.36 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  42 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 406 aa  315  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  48.01 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  46.02 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  48.01 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  53.63 
 
 		 358 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 415 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  45.66 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  47.1 
 
 		 400 aa  309  6.999999999999999e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  44.17 
 
 		 412 aa  308  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  43.32 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  48.36 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  44 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  45.61 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  45.53 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  47.57 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  44 
 
 		 408 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  42.14 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 410 aa  299  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  43.25 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  44.78 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  48.87 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  44.39 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  44.92 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  47.34 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  43.67 
 
 		 402 aa  292  9e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  44.36 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  43.58 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  43.86 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  49.38 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  49.38 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  42.78 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>