More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0554 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  93.42 
 
 		 441 aa  864    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 441 aa  911    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  42.23 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  39.82 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  36.45 
 
 		 499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  37.05 
 
 		 654 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  35.65 
 
 		 515 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  34.5 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 509 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  33.58 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  33.26 
 
 		 588 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  30.15 
 
 		 541 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  30.3 
 
 		 545 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  31.24 
 
 		 815 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  30.15 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  31.52 
 
 		 555 aa  202  9e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  31.52 
 
 		 555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  30.91 
 
 		 595 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  32 
 
 		 593 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  31.83 
 
 		 1121 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  30.8 
 
 		 583 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  31.81 
 
 		 544 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  31.88 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  30.52 
 
 		 1114 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  30.7 
 
 		 1112 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.17 
 
 		 1139 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  30.23 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  30.1 
 
 		 1116 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  30.12 
 
 		 1111 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  30.1 
 
 		 1116 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.02 
 
 		 1101 aa  176  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  44.27 
 
 		 258 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  29.07 
 
 		 1121 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  29.64 
 
 		 1113 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 		 1138 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.89 
 
 		 1137 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  31.78 
 
 		 647 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.89 
 
 		 1137 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.89 
 
 		 1137 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.89 
 
 		 1136 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  29.04 
 
 		 1104 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  29.69 
 
 		 1085 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  31.01 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  29.72 
 
 		 1154 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  28.11 
 
 		 1109 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  29.94 
 
 		 1154 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.52 
 
 		 1121 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  26.84 
 
 		 524 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  29.34 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 553 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  29.88 
 
 		 538 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.25 
 
 		 1102 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  29.72 
 
 		 1137 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.25 
 
 		 1102 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  28.69 
 
 		 1100 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  28.46 
 
 		 545 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  29.72 
 
 		 1137 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  28.18 
 
 		 541 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  28.91 
 
 		 551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  29.47 
 
 		 540 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28 
 
 		 1152 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 540 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  27.24 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  29.13 
 
 		 1109 aa  166  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  28.75 
 
 		 531 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  28.4 
 
 		 1102 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  27.69 
 
 		 1095 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  28.48 
 
 		 1112 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  28.37 
 
 		 1142 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.46 
 
 		 1131 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.46 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.46 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.46 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.46 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.52 
 
 		 1093 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.46 
 
 		 1131 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  26.46 
 
 		 534 aa  164  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  29.84 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  27.78 
 
 		 1088 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  29.84 
 
 		 572 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  27.86 
 
 		 1088 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  27.49 
 
 		 1092 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  27.86 
 
 		 1088 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  28.15 
 
 		 1100 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  29.38 
 
 		 535 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 554 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  29.25 
 
 		 1110 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.57 
 
 		 1115 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1160 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.07 
 
 		 1088 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  28.77 
 
 		 1093 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  28.23 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  27.48 
 
 		 1088 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  29.34 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 554 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>