178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0546 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  39.86 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  40.27 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  40 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  37.33 
 
 
149 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  39.07 
 
 
149 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  40.67 
 
 
153 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  40.85 
 
 
152 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  39.19 
 
 
153 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  38.41 
 
 
149 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  36.88 
 
 
150 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  37.75 
 
 
149 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  39.6 
 
 
150 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  37.75 
 
 
149 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  40.94 
 
 
152 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  41.29 
 
 
150 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
153 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  32.9 
 
 
188 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  41.22 
 
 
152 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  33.78 
 
 
150 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  32.43 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  35.71 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  33.12 
 
 
185 aa  97.4  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  34.46 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  34.46 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  37.75 
 
 
149 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  31.87 
 
 
185 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  33.99 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  30.52 
 
 
178 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  33.77 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  35.57 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  32.91 
 
 
167 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  39.04 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
184 aa  90.5  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  38.36 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  34.19 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  33.12 
 
 
177 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  36.88 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  33.56 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  33.55 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  33.55 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  33.56 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  34.01 
 
 
176 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  33.78 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  32.26 
 
 
172 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  33.1 
 
 
168 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  34 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  29.49 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  33.78 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  30.61 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  34 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  34 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  32.26 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  33.33 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2884  ArgR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0131006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  32.28 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  36.3 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
161 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  33.33 
 
 
149 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  32.89 
 
 
162 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  31.37 
 
 
177 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  30.13 
 
 
168 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  32.47 
 
 
161 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  33.56 
 
 
161 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  31.97 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  29.22 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  35.88 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  33.56 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  30.77 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  31.3 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1214  ArgR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1028  arginine repressor, ArgR  34.44 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  36.3 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  35.11 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  33.79 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2660  arginine repressor  29.8 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2716  arginine repressor  29.8 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  35.11 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  31.62 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  34.23 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  34.35 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  32.19 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  35.76 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  28.39 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  32.89 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  30.97 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  31.79 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1179  ArgR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000244542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>