More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0518 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  100 
 
 
435 aa  858    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  100 
 
 
435 aa  858    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  58.65 
 
 
446 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  57.14 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  59.18 
 
 
444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  54.95 
 
 
460 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  53.71 
 
 
468 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  53.9 
 
 
458 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  53.35 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  52.43 
 
 
461 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  53.62 
 
 
449 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  51.65 
 
 
441 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  53.16 
 
 
518 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  53.86 
 
 
471 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  51.8 
 
 
445 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  51.64 
 
 
525 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  50 
 
 
506 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  50.11 
 
 
478 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  52.49 
 
 
584 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  50.82 
 
 
509 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  50.83 
 
 
515 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  49.89 
 
 
511 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  50.83 
 
 
515 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  50.12 
 
 
497 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  49.46 
 
 
478 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  51.4 
 
 
507 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  51.17 
 
 
506 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  50.93 
 
 
507 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  42.33 
 
 
469 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  49.27 
 
 
408 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  51.81 
 
 
488 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  45.18 
 
 
441 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  46.82 
 
 
441 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  49.63 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  48.02 
 
 
478 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  45.25 
 
 
525 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  48.3 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  49.43 
 
 
512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  45.37 
 
 
439 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  45.48 
 
 
462 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  46.82 
 
 
442 aa  325  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  43.39 
 
 
414 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  46.19 
 
 
442 aa  322  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  46.3 
 
 
416 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  47.57 
 
 
441 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  48.11 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  47.1 
 
 
486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  47.1 
 
 
486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  44.39 
 
 
422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  46.43 
 
 
409 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  46.65 
 
 
489 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  46.86 
 
 
486 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  43.72 
 
 
433 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  42.83 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  42.29 
 
 
495 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.17 
 
 
1018 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  45.31 
 
 
409 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  45.52 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  44.05 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  46.54 
 
 
490 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  42.62 
 
 
1209 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  42.89 
 
 
416 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  44.86 
 
 
496 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  44.86 
 
 
496 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  42.82 
 
 
433 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  46.02 
 
 
487 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  44.66 
 
 
433 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  42.4 
 
 
446 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  42.14 
 
 
416 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  44 
 
 
416 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  46.04 
 
 
381 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  43.94 
 
 
416 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  42.14 
 
 
416 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  41.67 
 
 
416 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  41.74 
 
 
541 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  41.67 
 
 
416 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  41.67 
 
 
416 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  43.12 
 
 
426 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  42.62 
 
 
408 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  44.29 
 
 
416 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.72 
 
 
1016 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  42.82 
 
 
421 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  42.28 
 
 
416 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  42.28 
 
 
416 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  41.84 
 
 
416 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  42.37 
 
 
437 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  43.94 
 
 
417 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
717 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  41.67 
 
 
1322 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  42.52 
 
 
416 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  44.23 
 
 
489 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  42.47 
 
 
420 aa  289  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  42.09 
 
 
416 aa  288  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  44.52 
 
 
406 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  42.13 
 
 
414 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.26 
 
 
1262 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  44.26 
 
 
414 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  43.29 
 
 
417 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  40.92 
 
 
407 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  44.07 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>