More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0516 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
169 aa  357  6e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
169 aa  357  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.6 
 
 
170 aa  262  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.9 
 
 
170 aa  249  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.85 
 
 
169 aa  229  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.25 
 
 
148 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.04 
 
 
147 aa  183  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.42 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  56.55 
 
 
156 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 
145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.42 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.17 
 
 
161 aa  176  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  53.79 
 
 
156 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  54.48 
 
 
154 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.32 
 
 
154 aa  174  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.1 
 
 
154 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  54.29 
 
 
151 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.29 
 
 
151 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.69 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.46 
 
 
155 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
152 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.03 
 
 
156 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.02 
 
 
155 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  53.96 
 
 
158 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
151 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  56.74 
 
 
159 aa  168  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 
155 aa  167  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.69 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.35 
 
 
155 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
182 aa  158  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.97 
 
 
153 aa  158  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  50 
 
 
156 aa  157  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.23 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.24 
 
 
153 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  50 
 
 
157 aa  150  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.1 
 
 
159 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.35 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  50.35 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.95 
 
 
157 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  45.21 
 
 
165 aa  128  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.76 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.61 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  47.66 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  44.9 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  39.33 
 
 
187 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.89 
 
 
174 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  39.47 
 
 
173 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.52 
 
 
151 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.76 
 
 
174 aa  120  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.43 
 
 
167 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.41 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  41.13 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.07 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  43.07 
 
 
341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.72 
 
 
200 aa  114  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.39 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  44.14 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.37 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  41.72 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.6 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  43.57 
 
 
185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  41.96 
 
 
153 aa  111  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  40.28 
 
 
156 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48 
 
 
135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  45.38 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  42.14 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.65 
 
 
186 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  42.86 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  40 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  40.88 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.7 
 
 
145 aa  108  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.24 
 
 
179 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  40.69 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1248  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.97 
 
 
170 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.639553  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  40.82 
 
 
151 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  44.09 
 
 
185 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  43.31 
 
 
185 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.8 
 
 
194 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.15 
 
 
158 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131735  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.06 
 
 
151 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  42.11 
 
 
143 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  42.11 
 
 
143 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.73 
 
 
148 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.53 
 
 
164 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.29 
 
 
143 aa  99  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.01 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.71 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>