More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0509 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  100 
 
 
363 aa  718    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.93 
 
 
414 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.84 
 
 
381 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  35.2 
 
 
381 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  26.68 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  26.68 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  26.68 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.61 
 
 
399 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.08 
 
 
399 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.6 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.19 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.32 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.98 
 
 
400 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  28.28 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.59 
 
 
397 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.72 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  32.66 
 
 
364 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.82 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.08 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  32.79 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34.09 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  26.97 
 
 
414 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.03 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.35 
 
 
402 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.14 
 
 
300 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  26.6 
 
 
374 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.72 
 
 
401 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  35.04 
 
 
408 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  27.73 
 
 
389 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.08 
 
 
405 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.94 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.94 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.12 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.46 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.97 
 
 
320 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.58 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  26.67 
 
 
390 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.22 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.06 
 
 
404 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.06 
 
 
401 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  26.13 
 
 
393 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.23 
 
 
425 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  26.34 
 
 
406 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.05 
 
 
397 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  27.67 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  29.53 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.89 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.63 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  30.07 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.81 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  31.53 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.37 
 
 
422 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.76 
 
 
429 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.24 
 
 
408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.09 
 
 
410 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.61 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.74 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  25.96 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  28.63 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.06 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.24 
 
 
417 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.67 
 
 
403 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.09 
 
 
406 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  24.93 
 
 
384 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  25.32 
 
 
420 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  27.06 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.57 
 
 
385 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.14 
 
 
405 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  25.95 
 
 
401 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.07 
 
 
408 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  26.65 
 
 
404 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  29.08 
 
 
363 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.34 
 
 
425 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  25.66 
 
 
393 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.67 
 
 
298 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  25.07 
 
 
408 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  25.07 
 
 
408 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.22 
 
 
396 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  26.84 
 
 
404 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.07 
 
 
392 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  23.41 
 
 
395 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.96 
 
 
434 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.57 
 
 
425 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.84 
 
 
406 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.82 
 
 
443 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.23 
 
 
404 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.81 
 
 
402 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.23 
 
 
417 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  31.2 
 
 
307 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  23.1 
 
 
410 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.32 
 
 
303 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.6 
 
 
406 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  23.32 
 
 
393 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  27.22 
 
 
420 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  27.7 
 
 
429 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.63 
 
 
400 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  27.16 
 
 
391 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  24.46 
 
 
407 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  25 
 
 
402 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>