More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0500 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  727    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  54.79 
 
 
363 aa  381  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  51.39 
 
 
355 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  51.39 
 
 
355 aa  354  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  52.23 
 
 
356 aa  350  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  50.41 
 
 
364 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  53.39 
 
 
365 aa  349  4e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.37 
 
 
367 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.37 
 
 
367 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50 
 
 
381 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.67 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.28 
 
 
369 aa  333  4e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  49.86 
 
 
380 aa  332  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.7 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
364 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
364 aa  329  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
364 aa  328  7e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
352 aa  326  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.6 
 
 
370 aa  324  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
364 aa  324  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.56 
 
 
366 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
364 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.28 
 
 
374 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  45.92 
 
 
366 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 
360 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  48.2 
 
 
365 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
362 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  47.78 
 
 
365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.92 
 
 
360 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  46.65 
 
 
352 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.75 
 
 
367 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.04 
 
 
353 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  47.91 
 
 
375 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  46.38 
 
 
351 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.83 
 
 
385 aa  315  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
370 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  45.51 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  46.38 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.76 
 
 
355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  45.28 
 
 
355 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  46.76 
 
 
355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.51 
 
 
370 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  46.24 
 
 
358 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  45.2 
 
 
354 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  46.03 
 
 
366 aa  311  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.22 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.53 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  45.84 
 
 
379 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  45.36 
 
 
365 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  46.74 
 
 
402 aa  309  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.99 
 
 
366 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.49 
 
 
370 aa  309  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  47.12 
 
 
369 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  46.56 
 
 
353 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
366 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.5 
 
 
363 aa  308  9e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  46.78 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  47.54 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  44.47 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  46.58 
 
 
364 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  47.63 
 
 
358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  44.69 
 
 
335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
368 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  44.69 
 
 
335 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  45.98 
 
 
354 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  43.63 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  46.59 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  46.03 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  45.4 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  46.02 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2302  ABC transporter related  46.55 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996895  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  45.61 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  44.65 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.21 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  45.89 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  46.69 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  44.76 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  46.09 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  46.5 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  51.13 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  44.26 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  45.35 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  43.45 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  44.41 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.86 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>