126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0471 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
220 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  99.09 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  62.01 
 
 
229 aa  297  7e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  63 
 
 
233 aa  294  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  56.22 
 
 
261 aa  258  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  50 
 
 
228 aa  221  7e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  45.15 
 
 
316 aa  197  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  45.37 
 
 
284 aa  194  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  45.13 
 
 
325 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  44.44 
 
 
293 aa  192  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  44.44 
 
 
292 aa  188  5e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  46.12 
 
 
305 aa  188  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  44.39 
 
 
318 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  42.73 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  41.96 
 
 
310 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  44.25 
 
 
316 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  43.13 
 
 
253 aa  179  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  42.67 
 
 
310 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  40.62 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  41.13 
 
 
313 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  42.36 
 
 
243 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  41.26 
 
 
233 aa  141  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  39.73 
 
 
235 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.08 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.17 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.17 
 
 
266 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.53 
 
 
237 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  39.88 
 
 
254 aa  99  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.36 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  40.51 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.12 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  33.33 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  30.89 
 
 
231 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  32.94 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  33.16 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.78 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.22 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.78 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  29.59 
 
 
229 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  33.73 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.73 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  34.59 
 
 
245 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.8 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  32.28 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  32.93 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  34.88 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  33.85 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.06 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  34.72 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  32.56 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  31.69 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.56 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  31.69 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  32.98 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  32.52 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  31.15 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.43 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  31.07 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  33.53 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  31.91 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.08 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  27.37 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  29.59 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  30.26 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  28.42 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  30.69 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  30.69 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  29.41 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  29.89 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  31.46 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  34.83 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.29 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2063  FAD-dependent thymidylate synthase  29.69 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.828676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.34 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  32.09 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  32.09 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  28.24 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  33.93 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  31.68 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  33.84 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  28.4 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.63 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.32 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1861  FAD-dependent thymidylate synthase  27.69 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.63 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  29.52 
 
 
282 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.52 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.52 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.7 
 
 
216 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.76 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  32.35 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.83 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.09 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  28.57 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>