More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0428 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 328 aa  682    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 328 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.87 
 
 		 331 aa  502  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 		 327 aa  474  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 325 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 359 aa  364  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 327 aa  348  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 327 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 331 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 326 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 354 aa  298  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  46.65 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 405 aa  281  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.02 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 373 aa  248  9e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.51 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.62 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.74 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.04 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.54 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.62 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.15 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.46 
 
 		 342 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.96 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.19 
 
 		 340 aa  228  8e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.24 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.69 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.85 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 405 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.85 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>