41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0360 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  81.97 
 
 
183 aa  315  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  77.05 
 
 
183 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  76.5 
 
 
183 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  77.05 
 
 
183 aa  304  6e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  77.6 
 
 
183 aa  298  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  54.49 
 
 
188 aa  194  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  55.87 
 
 
194 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  49.4 
 
 
195 aa  161  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  32.92 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1245  hypothetical protein  48.96 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  35.29 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  36.6 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  35.95 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  32.75 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  33.33 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  30.26 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  30.92 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  33.75 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  28.76 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  28.48 
 
 
161 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  27.4 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  29.59 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  28.77 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  27.78 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  27.97 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  29.05 
 
 
181 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  26.49 
 
 
187 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  28.4 
 
 
168 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  29.01 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  28.4 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  27.33 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>