More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0330 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
336 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
336 aa  651    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1282  rod shape-determining protein MreB  72.21 
 
 
337 aa  475  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1498  rod shape-determining protein MreB  71.3 
 
 
337 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1420  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  59.16 
 
 
343 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
344 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  58.56 
 
 
343 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  57.7 
 
 
343 aa  381  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 
343 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 
340 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 
340 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 
346 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 
340 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.98 
 
 
344 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 
343 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  54.87 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  57.75 
 
 
339 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  55.16 
 
 
344 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 
344 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  55.16 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  55.93 
 
 
342 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  54.87 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  54.93 
 
 
347 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 
347 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
344 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 
347 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 
344 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.01 
 
 
344 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 
342 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  53.71 
 
 
345 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 
342 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 
347 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  55.82 
 
 
347 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 
344 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 
349 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 
347 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 
347 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  54.82 
 
 
343 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  54.82 
 
 
343 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  55.15 
 
 
368 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.31 
 
 
344 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 
342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 
348 aa  360  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 
347 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.22 
 
 
344 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  53.82 
 
 
335 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 
338 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  55.15 
 
 
340 aa  359  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  52.57 
 
 
345 aa  358  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 
349 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 
350 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
339 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  56.36 
 
 
338 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 
343 aa  355  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  55.66 
 
 
335 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 
346 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 
348 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 
345 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  54.38 
 
 
424 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.66 
 
 
350 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  54.38 
 
 
350 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  54.38 
 
 
350 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 
345 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  52.1 
 
 
343 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
360 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  52.24 
 
 
346 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  53.25 
 
 
342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  53.13 
 
 
346 aa  352  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 
359 aa  352  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 
350 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 
350 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 
366 aa  351  8e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  53.89 
 
 
336 aa  351  8.999999999999999e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  53.17 
 
 
343 aa  351  8.999999999999999e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  52.44 
 
 
343 aa  350  1e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  51.68 
 
 
333 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  54.24 
 
 
336 aa  350  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  56.57 
 
 
358 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  51.94 
 
 
346 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
345 aa  349  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 
345 aa  349  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  51.51 
 
 
343 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
347 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>