166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0311 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  2.02771e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  92.78 
 
 
291 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 
298 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 
293 aa  212  5e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 
301 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  37.54 
 
 
335 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
301 aa  172  7e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  34.83 
 
 
305 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 
308 aa  147  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  31.19 
 
 
297 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
266 aa  80.1  4e-14  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
278 aa  75.9  9e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 
269 aa  70.5  3e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  23.19 
 
 
319 aa  64.7  2e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
317 aa  64.3  2e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  24.53 
 
 
306 aa  64.7  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  25.85 
 
 
314 aa  61.6  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
309 aa  61.2  2e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
307 aa  60.5  4e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
272 aa  59.3  7e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 
214 aa  59.3  7e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  21.4 
 
 
306 aa  59.3  7e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  22.69 
 
 
319 aa  59.3  8e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
319 aa  58.9  9e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 
317 aa  58.5  1e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  27.08 
 
 
232 aa  58.2  2e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 
306 aa  58.2  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
309 aa  58.2  2e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
313 aa  57  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
308 aa  56.6  5e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  26.42 
 
 
239 aa  56.6  5e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
198 aa  56.6  5e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 
309 aa  56.2  6e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1096  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
309 aa  55.8  8e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
317 aa  55.8  9e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  27.86 
 
 
329 aa  55.1  1e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.93 
 
 
306 aa  55.1  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  23.49 
 
 
307 aa  53.9  3e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  25.25 
 
 
207 aa  53.5  4e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.86838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
342 aa  53.5  4e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  23.83 
 
 
197 aa  53.5  4e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  23.49 
 
 
307 aa  53.5  4e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 
206 aa  52.8  8e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 
310 aa  52.4  9e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 
325 aa  51.6  1e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
330 aa  52  1e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 
197 aa  52  1e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
220 aa  51.2  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 
312 aa  51.6  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.2 
 
 
290 aa  50.4  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
213 aa  50.4  3e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
240 aa  50.1  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
308 aa  50.1  4e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 
304 aa  50.1  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  22.54 
 
 
263 aa  49.7  5e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
210 aa  49.7  6e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  22.38 
 
 
309 aa  49.3  7e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0809  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.72 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  21.6 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  34.85 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  25.45 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  23.36 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
209 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
425 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.49222e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  22.99 
 
 
312 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25.12 
 
 
215 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 
230 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  24.06 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  25.49 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  20 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  31.82 
 
 
292 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
209 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
209 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
322 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 
306 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  25.83 
 
 
250 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.83 
 
 
250 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.68 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.83 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
209 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  24.21 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.03 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.53605e-09  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  24.68 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>