24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0259 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0257  flagellar hook-length control protein  94.43 
 
 		 674 aa  1242    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0259  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 658 aa  1317    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  26.17 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  25.87 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  30.1 
 
 		 480 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 		 544 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 660 aa  47.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  32 
 
 		 552 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  25.81 
 
 		 407 aa  47.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1291  hypothetical protein  30.43 
 
 		 736 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.544627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  25.45 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  27.94 
 
 		 768 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  25.45 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  30.16 
 
 		 508 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  25.66 
 
 		 527 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  29.41 
 
 		 623 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  26.6 
 
 		 580 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  33.96 
 
 		 686 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  31.75 
 
 		 579 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  30.16 
 
 		 512 aa  44.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  31.52 
 
 		 487 aa  44.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  26.36 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  29.23 
 
 		 568 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  35.14 
 
 		 369 aa  44.3  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>