256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0258 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  100 
 
 
224 aa  448  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  99.11 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  46.15 
 
 
221 aa  202  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  43.43 
 
 
218 aa  182  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  46.11 
 
 
220 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  36.67 
 
 
235 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  36.54 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  32.86 
 
 
225 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  35.59 
 
 
229 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.39 
 
 
225 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  40 
 
 
263 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  37.82 
 
 
223 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  31.18 
 
 
230 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  31.36 
 
 
229 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  31.79 
 
 
221 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  30.35 
 
 
223 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  32.6 
 
 
225 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  31.55 
 
 
226 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  33.53 
 
 
234 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 
218 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.53 
 
 
235 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  35.76 
 
 
225 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36.48 
 
 
221 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  33.02 
 
 
294 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  33.02 
 
 
294 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  29.44 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  31.05 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  31.75 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  30.15 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  33.76 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  33.91 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  27.46 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.86 
 
 
227 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  34.01 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  33.78 
 
 
265 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  30.23 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  26.29 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  31.31 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  28.37 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  31.15 
 
 
233 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  34.29 
 
 
228 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  35.11 
 
 
224 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 
226 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  34.32 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  33.77 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  34.87 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  29.82 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  34.67 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  28.5 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  32.42 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  27.51 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  33.77 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  28.16 
 
 
228 aa  84.7  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  27.51 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  32.53 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  32 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  29.84 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  26.98 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  29.9 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  32.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  31.33 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  31.33 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  32.24 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  28.35 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  32.24 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  30.36 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  27.1 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  29.23 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30.1 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  28.1 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  28.1 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  27.18 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  27.23 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  27.01 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  25 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  29.23 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  30.54 
 
 
256 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  27.32 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>