More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0228 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  53.5 
 
 
673 aa  671    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  61.1 
 
 
673 aa  778    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  62.61 
 
 
674 aa  826    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  95.83 
 
 
671 aa  1171    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
671 aa  1321    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 
666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
713 aa  565  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.83 
 
 
677 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  43.96 
 
 
692 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
697 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
675 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
691 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
666 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
660 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
696 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
681 aa  507  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
695 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
679 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  41.48 
 
 
685 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
701 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 
653 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  38.26 
 
 
670 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  38.52 
 
 
667 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  38.52 
 
 
667 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  38.52 
 
 
667 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  38.55 
 
 
670 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  38.14 
 
 
672 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  38 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  37.59 
 
 
702 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
658 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  34.84 
 
 
660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
686 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
677 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
664 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
649 aa  399  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
702 aa  399  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.16 
 
 
681 aa  399  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
670 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
675 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
687 aa  392  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
652 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 
652 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 
654 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
657 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 
654 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.97 
 
 
654 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
654 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
671 aa  385  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  33.29 
 
 
674 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 
652 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.94 
 
 
669 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.31 
 
 
720 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.97 
 
 
654 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
719 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.83 
 
 
654 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 
654 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
650 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
770 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.53 
 
 
655 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
669 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
671 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  35.08 
 
 
662 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
702 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
709 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
654 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
919 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
669 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
919 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
669 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
669 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
690 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
694 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  34.99 
 
 
681 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
702 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  34.26 
 
 
669 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
920 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
695 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  47.01 
 
 
1089 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
954 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  36.54 
 
 
691 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.1 
 
 
715 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  34.62 
 
 
708 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
712 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  34.5 
 
 
686 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  35 
 
 
692 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
558 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.53 
 
 
700 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
724 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
957 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
709 aa  363  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  33.05 
 
 
714 aa  361  2e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
652 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
694 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
686 aa  359  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  39.31 
 
 
1010 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
679 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 
606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>