More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0227 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 		 408 aa  820    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  98.53 
 
 		 408 aa  808    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  48.38 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  46.42 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  42.34 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  43.8 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  41.63 
 
 		 411 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  41.73 
 
 		 411 aa  298  8e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  43.31 
 
 		 412 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  40.44 
 
 		 403 aa  289  8e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.48 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.02 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.02 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  39.02 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  38.54 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.59 
 
 		 413 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  39.27 
 
 		 412 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  38.78 
 
 		 412 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.78 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.78 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.94 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  38.54 
 
 		 412 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  39.6 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  39.75 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.29 
 
 		 412 aa  272  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  38.35 
 
 		 413 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  37.8 
 
 		 412 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.11 
 
 		 420 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  38.39 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35.35 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  39.31 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  37.59 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.83 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  36.39 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.47 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.68 
 
 		 417 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  38.75 
 
 		 423 aa  249  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.02 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.99 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  37.05 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.59 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  36.96 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  35.77 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.08 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.92 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.96 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.19 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  35.7 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  34.58 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  35.93 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  35.99 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.89 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  34.31 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  33.89 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  36.45 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.21 
 
 		 416 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.16 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.67 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.21 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.58 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  39.76 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.52 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  34.5 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  33.97 
 
 		 415 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  34.94 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  37.05 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  33.88 
 
 		 423 aa  225  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  34.72 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  34.56 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.16 
 
 		 414 aa  222  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  35.03 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  34.9 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  33.42 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  33.01 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  35.76 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  33.1 
 
 		 423 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.42 
 
 		 408 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  33.66 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  34.12 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.5 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  31.09 
 
 		 447 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  33.09 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  33.1 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  33.67 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  32.86 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  32.86 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  33.58 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.13 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  35.53 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  33.66 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  33.64 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  33.91 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  32.44 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  31.63 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  33.02 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  35.18 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  32.76 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>