More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0182 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
402 aa  801    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  99.75 
 
 
402 aa  800    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  54.48 
 
 
401 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 
379 aa  330  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  43.19 
 
 
426 aa  307  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  41.44 
 
 
430 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 
430 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  43.02 
 
 
400 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.8 
 
 
443 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  39.33 
 
 
457 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 
397 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.75 
 
 
443 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 
410 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  43.24 
 
 
439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.95 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  41.55 
 
 
461 aa  246  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.16 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  39.63 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  37.8 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  41.08 
 
 
379 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.74 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  41.39 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.9 
 
 
456 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.84 
 
 
445 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 
429 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 
457 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 
451 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.03 
 
 
426 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  38.62 
 
 
438 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  42.52 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 
444 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
444 aa  239  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  38.99 
 
 
468 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 
428 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  38.44 
 
 
428 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.1 
 
 
441 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 
383 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  39.22 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
442 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  41.05 
 
 
481 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  41.46 
 
 
434 aa  235  9e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.67 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  38.23 
 
 
417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.6 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  41.83 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 
478 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  41.83 
 
 
446 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  40.54 
 
 
453 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  40.54 
 
 
450 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.33 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  42.41 
 
 
440 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 
455 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.57 
 
 
482 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 
482 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  40.65 
 
 
424 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  40.65 
 
 
424 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  44.41 
 
 
444 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  39.78 
 
 
437 aa  231  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  40.66 
 
 
453 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 
440 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  39.95 
 
 
440 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  39.95 
 
 
440 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.33 
 
 
476 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  41.09 
 
 
463 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.54 
 
 
432 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 
439 aa  230  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 
439 aa  229  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  40.16 
 
 
440 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 
455 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  40.31 
 
 
478 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.73 
 
 
445 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.73 
 
 
445 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.67 
 
 
428 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.65 
 
 
458 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  39.16 
 
 
407 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  38.42 
 
 
387 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  39.27 
 
 
435 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  37.94 
 
 
418 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.8 
 
 
434 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  37.06 
 
 
480 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  40.36 
 
 
456 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  34.47 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 
433 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  38.85 
 
 
444 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.98 
 
 
441 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  38.89 
 
 
389 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  39.32 
 
 
434 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 
449 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  41.03 
 
 
444 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  39.6 
 
 
433 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  38.39 
 
 
430 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  40.69 
 
 
479 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  42.07 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
438 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  38.49 
 
 
434 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  39.61 
 
 
444 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  37.7 
 
 
463 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  39.94 
 
 
444 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>