More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0119 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  98.49 
 
 		 465 aa  936    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 467 aa  946    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0689  glycoside hydrolase family 3 protein  35.91 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.43 
 
 		 698 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.93 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.88 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.69 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.5 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.87 
 
 		 492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.18 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 		 845 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.79 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.77 
 
 		 1003 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  31.41 
 
 		 604 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.97 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  30.79 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.94 
 
 		 594 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.19 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.4 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.93 
 
 		 490 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 633 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.73 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  33.79 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  31.67 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.77 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.83 
 
 		 373 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  29.71 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.04 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  28.28 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 		 504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.57 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.46 
 
 		 379 aa  147  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  34.05 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.98 
 
 		 534 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.24 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.98 
 
 		 534 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  31.14 
 
 		 637 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 		 365 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.92 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  32.93 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.74 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.24 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  32.58 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.76 
 
 		 966 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  30.43 
 
 		 520 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  27.83 
 
 		 375 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  32.87 
 
 		 557 aa  143  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  32.14 
 
 		 673 aa  143  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 365 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.58 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  32.61 
 
 		 393 aa  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  28.47 
 
 		 589 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.72 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.98 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  29.09 
 
 		 923 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.91 
 
 		 375 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  30.51 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.94 
 
 		 976 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.73 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.87 
 
 		 596 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  31.38 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.32 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.65 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.45 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  33.98 
 
 		 631 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  34.56 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.94 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  34.35 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.69 
 
 		 990 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.2 
 
 		 499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.51 
 
 		 568 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.04 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  32.16 
 
 		 656 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.23 
 
 		 582 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.47 
 
 		 575 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  33.46 
 
 		 475 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.86 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.34 
 
 		 598 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.92 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.45 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.84 
 
 		 338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.26 
 
 		 337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.71 
 
 		 580 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.73 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  34.63 
 
 		 575 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  32.38 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  34.62 
 
 		 337 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  28.31 
 
 		 734 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 		 699 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.34 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>