More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0100 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  100 
 
 
234 aa  461  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  97.86 
 
 
234 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0972  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.23 
 
 
244 aa  184  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0677  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  41.45 
 
 
239 aa  164  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1861  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component-like protein  33.05 
 
 
242 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1654  ABC transporter related  27.23 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.05 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.263903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.38 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0729  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  28.43 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1525  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.4 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.198861  normal  0.606343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08641  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.82 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0550  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.34 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0373794  hitchhiker  0.0000103016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  27.04 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  28 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.59 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2546  ABC transporter related protein  25.51 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  26.2 
 
 
375 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  23.77 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  27.85 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  24.67 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  23.93 
 
 
421 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  24.62 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  28.1 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.41 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  24.78 
 
 
292 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1089  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.5 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.745288  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  26.72 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  26.14 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0483  phosphate ABC transporter ATPase subunit  27.16 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  24.26 
 
 
371 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.8 
 
 
581 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  27.35 
 
 
219 aa  58.9  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  26.78 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  22.81 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  23.61 
 
 
426 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  27.11 
 
 
372 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  22.98 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  26.36 
 
 
364 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  22.55 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  24.48 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  26.54 
 
 
343 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.68 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  25.64 
 
 
421 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  23.55 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  24.69 
 
 
299 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  25.62 
 
 
570 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  24.89 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  24.89 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1468  ABC transporter related protein  25.7 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  25.12 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.18 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.11 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  24.66 
 
 
373 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4407  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.81 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0221693  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15211  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.5 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  27.07 
 
 
371 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  23.77 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  22.93 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  20.41 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  27.8 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  29.44 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  20.6 
 
 
256 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.94 
 
 
297 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  24.89 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  27.23 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  24.49 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  24.35 
 
 
369 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  26.75 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  25.75 
 
 
337 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  26.5 
 
 
362 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2120  putative ABC transporter, ATP-binding protein  25.94 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  22.22 
 
 
318 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  23.65 
 
 
279 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  24.09 
 
 
295 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  24.24 
 
 
377 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  25.21 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  25.46 
 
 
293 aa  55.5  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 
272 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  25.76 
 
 
340 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  26.58 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  23.53 
 
 
478 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  25.76 
 
 
333 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  25.21 
 
 
381 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  25.21 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  25.21 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  25.21 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  22.86 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  25.21 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.95 
 
 
579 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0048  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.49 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240899  normal  0.357685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  25.64 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  28.33 
 
 
594 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  25 
 
 
372 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>