More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0088 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0088  cell cycle protein  100 
 
 		 336 aa  659    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000070241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0088  cell cycle protein  96.13 
 
 		 336 aa  578  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0635  cell cycle protein  44.67 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0123937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1005  cell cycle protein  44.2 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0721035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1368  cell cycle protein  40.42 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  38.94 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.84 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  34.67 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  33.73 
 
 		 368 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.12 
 
 		 379 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.21 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  35.79 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 371 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.55 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  34.21 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.72 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  35.94 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.9 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  32.64 
 
 		 369 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.34 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  35.76 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  37.35 
 
 		 403 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.33 
 
 		 371 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  35.36 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  34.85 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  30.75 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  36.72 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.99 
 
 		 423 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  33.14 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.38 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  32.93 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  32.94 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.93 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.29 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 368 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.44 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  36.06 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 373 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  32.85 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  33.33 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.64 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  34.52 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.4 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  36.62 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  33.75 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  34.37 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  31.69 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  34.24 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  34.37 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  34.37 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.84 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  34.74 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  34.34 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  31.33 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.67 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.39 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 		 390 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  32.04 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  32.34 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  33.22 
 
 		 371 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  33.84 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  34.34 
 
 		 362 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  32.38 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  31.73 
 
 		 422 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  32.28 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  31.13 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  31.16 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 378 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  31.63 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.94 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  33.33 
 
 		 543 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  33.03 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  32.02 
 
 		 384 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.91 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  31.17 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  30.93 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  32.02 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>