289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0083 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  39.49 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  36.31 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.97 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  38.31 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  35.06 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.95 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  37.01 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  39.87 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  37.01 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.29 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.96 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  39.87 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.64 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  35.57 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  34.64 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.97 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  38.31 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 160 aa  96.7  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  31.82 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  27.92 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000270066  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  31.82 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  32.68 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  32.24 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  33.12 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  31.58 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  27.92 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  32.68 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4518  protein of unknown function DUF163  33.11 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.600852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  32.03 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  32.03 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 		 177 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  27.27 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  31.37 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  29.22 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  32.03 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>