More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0001 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 440 aa  892    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  97.05 
 
 		 440 aa  846    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.33 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000928481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.57 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000143167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.7 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000297027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.25 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.93 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  38.8 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.93 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  36.61 
 
 		 450 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.99 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.99 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.72 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  37.92 
 
 		 436 aa  302  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.51 
 
 		 453 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  36.65 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.95 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  36.65 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.1 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.66 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 		 460 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  34.96 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  36.3 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.43 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  35.83 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  36.47 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.59 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.27 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.56 
 
 		 461 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.36 
 
 		 446 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.21 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.44 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  34.98 
 
 		 451 aa  286  7e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 		 440 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  36.57 
 
 		 490 aa  282  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.21 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 		 445 aa  279  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  34.3 
 
 		 458 aa  279  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.8 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  34.38 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.88 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  36.32 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  35.55 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 503 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  35.83 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  34.38 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  34.35 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.14 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.15 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.49 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  36.64 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  34.58 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  33.11 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.84 
 
 		 454 aa  265  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.52 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.79 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  35.94 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  35.54 
 
 		 491 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  36.62 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  35.33 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 478 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.97 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.2 
 
 		 477 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  35.6 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.59 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 		 475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.92 
 
 		 441 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  34.07 
 
 		 477 aa  257  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  34.01 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.49 
 
 		 469 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.77 
 
 		 498 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  33.7 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.03 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.35 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.49 
 
 		 470 aa  253  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  34.01 
 
 		 464 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  42.77 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.88 
 
 		 591 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.88 
 
 		 587 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  39.88 
 
 		 615 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>