42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1697 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  53.09 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  43.42 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  40.51 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  47.06 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  41.86 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  40.79 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  41.03 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  45.31 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  57.14 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  37.62 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0856  DNA polymerase beta subunit  48.05 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.917822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  37.8 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  40.7 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.7 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  40.7 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  35.44 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  36.92 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  35.71 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  29.63 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3225  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  39.68 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  40.3 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  27.14 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  52.5 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1550  DNA polymerase beta subunit  48.57 
 
 		 225 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0936126 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  42.5 
 
 		 80 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>