More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1675 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
513 aa  1057    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  49.31 
 
 
517 aa  482  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  43.31 
 
 
489 aa  376  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  41.02 
 
 
467 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 
486 aa  354  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  37.15 
 
 
885 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 
934 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  31.67 
 
 
418 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  30.16 
 
 
436 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  30.72 
 
 
417 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 
442 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  28.54 
 
 
450 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  27.47 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
431 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
431 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  27.13 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  27.2 
 
 
446 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  27.92 
 
 
449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  26.1 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  26.9 
 
 
452 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  27.79 
 
 
452 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  27.53 
 
 
458 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  28.14 
 
 
482 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  28.63 
 
 
465 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
399 aa  151  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  29.86 
 
 
459 aa  150  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  27.38 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  26.17 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  26.68 
 
 
457 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  27.08 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  26.33 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  28.14 
 
 
467 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  27.43 
 
 
443 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  26.72 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  26.45 
 
 
444 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  26.53 
 
 
451 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.53 
 
 
451 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  26.79 
 
 
470 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
427 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.48 
 
 
451 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  26.4 
 
 
443 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  24.67 
 
 
474 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  26.18 
 
 
472 aa  143  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  25.42 
 
 
478 aa  143  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.01 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  27.78 
 
 
457 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  26.26 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  26.05 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  25.68 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  26.62 
 
 
487 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  27.86 
 
 
461 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  27.69 
 
 
459 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  27.57 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.81 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  27.5 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  27.53 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  28.17 
 
 
470 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  26.6 
 
 
446 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  26.67 
 
 
444 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  26.81 
 
 
479 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  27.12 
 
 
466 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  27.94 
 
 
457 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.16 
 
 
447 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  28.77 
 
 
436 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  27.53 
 
 
464 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  25.99 
 
 
470 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  26.03 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.64 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  26.25 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  26.34 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  25.45 
 
 
491 aa  135  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  26.92 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  25.14 
 
 
478 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  26.97 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  27.95 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  26.17 
 
 
479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  26.44 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  24.8 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  26.83 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  26.89 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  24.24 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  25.79 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  27.13 
 
 
453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  25.79 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  25.79 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  25.79 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  24.9 
 
 
460 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  25.68 
 
 
443 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  25.48 
 
 
438 aa  130  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  25.79 
 
 
460 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  27.72 
 
 
500 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  25.72 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  24.01 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  28.22 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  26.8 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  26.53 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.37 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  28.49 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>