More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1658 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  100 
 
 		 444 aa  882    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  37.45 
 
 		 231 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  36.6 
 
 		 232 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  39.39 
 
 		 239 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  39.47 
 
 		 246 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  36.44 
 
 		 231 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  34.98 
 
 		 251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  39.44 
 
 		 224 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  36.61 
 
 		 228 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 248 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  40.66 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  38.89 
 
 		 236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  41.55 
 
 		 232 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  41.77 
 
 		 227 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  38.12 
 
 		 231 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  38.46 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  35.92 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  35.48 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  43.33 
 
 		 246 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  37.93 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  38.89 
 
 		 245 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  38.22 
 
 		 220 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  39.32 
 
 		 231 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  37.57 
 
 		 247 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  38.56 
 
 		 237 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  36.92 
 
 		 229 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  35.9 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  41.32 
 
 		 225 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  39.06 
 
 		 258 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  35.98 
 
 		 238 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  34.42 
 
 		 284 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  38.67 
 
 		 245 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  38.95 
 
 		 219 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  39.18 
 
 		 211 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  44.22 
 
 		 246 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  35.51 
 
 		 222 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  36.59 
 
 		 324 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  40.76 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  34.16 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  35.06 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  36.53 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  40.96 
 
 		 249 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  43.54 
 
 		 246 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  43.54 
 
 		 246 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  41.33 
 
 		 260 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  35.06 
 
 		 243 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  34.67 
 
 		 223 aa  99.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  38.21 
 
 		 252 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  41.67 
 
 		 230 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  35.05 
 
 		 222 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  38.32 
 
 		 239 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  38.05 
 
 		 197 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  35.68 
 
 		 237 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  38.29 
 
 		 232 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  36.48 
 
 		 223 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  37.44 
 
 		 215 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  35.36 
 
 		 252 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  41.98 
 
 		 234 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  37.32 
 
 		 246 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  36.93 
 
 		 237 aa  93.6  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  33.5 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  37.64 
 
 		 253 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  37.5 
 
 		 222 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  43.92 
 
 		 219 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  33.79 
 
 		 234 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  37.5 
 
 		 256 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  32.02 
 
 		 360 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  36.81 
 
 		 233 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 360 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  42.28 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  33.66 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  33.66 
 
 		 260 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  41.72 
 
 		 230 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  32.47 
 
 		 263 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  39.46 
 
 		 251 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  33.01 
 
 		 227 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  34.1 
 
 		 218 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  34.17 
 
 		 371 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  39.86 
 
 		 251 aa  87  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  33.66 
 
 		 229 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  34.69 
 
 		 198 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  41.48 
 
 		 264 aa  86.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  31.55 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  33.99 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  33.99 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  33.99 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  33.99 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  35.19 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  34.72 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.47 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  33.65 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  41.1 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  36.24 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  33 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.12 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  33 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.06 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.17 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  36.24 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>