More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1640 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 503 aa  964    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  31.25 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  32.6 
 
 		 452 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 445 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  29.08 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  28.87 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 555 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  28.48 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  28.28 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  27.13 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  27.67 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 429 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  26.75 
 
 		 517 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  24.39 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 576 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  30.09 
 
 		 426 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  28.76 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  27.25 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  28.87 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 529 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  23.98 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  31.4 
 
 		 716 aa  140  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 543 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 		 635 aa  137  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 533 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.84 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.6 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.6 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  29.91 
 
 		 541 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  28.7 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  29.91 
 
 		 664 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  27.07 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.08 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  29.07 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 616 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  29.34 
 
 		 666 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 541 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 541 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 537 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  30.16 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  28.22 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 647 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  23.85 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  27.53 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  28.5 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 541 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.65 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  28.47 
 
 		 528 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.41 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  29.63 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.21 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 630 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  32.29 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.21 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  30.7 
 
 		 467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  26.54 
 
 		 542 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.08 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  30.86 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  30.46 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  33.85 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.97 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>