More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1620 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 297 aa  600  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  32.03 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2063  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0935  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  29.86 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.77 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  29 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  26.67 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  25.61 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  26.1 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.54 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.42 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  28.23 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.73 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  26.02 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  29.75 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  28.42 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  26.67 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.36 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  27.18 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  28.26 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  26.94 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0934  dihydrodipicolinate synthetase  28.17 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.090977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.69 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0309  dihydrodipicolinate synthetase  26.85 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  27.04 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  27.84 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  32.07 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  25.28 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  24.31 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1296  2-keto-3-deoxygalactonate aldolase / 2-keto-3-deoxy-phosphogalactonate aldolase / 2-keto-3-deoxy-phosphogluconate aldolase / 2-keto-3-deoxygluconate aldolase  25.61 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  28.94 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.41 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  24.74 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.04 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  24.74 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  24.74 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  24.74 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  27.51 
 
 		 390 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  23.24 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  25.09 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>