220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1606 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  56.11 
 
 
184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  56.59 
 
 
184 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  54.1 
 
 
168 aa  206  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  54.64 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  53.33 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  55.14 
 
 
185 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  52.46 
 
 
170 aa  191  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  52.17 
 
 
170 aa  191  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  52.17 
 
 
170 aa  191  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  54.1 
 
 
167 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  53.89 
 
 
182 aa  185  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  52.75 
 
 
182 aa  179  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  47.54 
 
 
169 aa  178  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  49.73 
 
 
169 aa  174  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  45.9 
 
 
167 aa  168  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  49.42 
 
 
165 aa  155  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  46.33 
 
 
165 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  48.86 
 
 
166 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  45.45 
 
 
165 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  46.51 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  47.16 
 
 
164 aa  144  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  44.07 
 
 
166 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  44.89 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  42.61 
 
 
166 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  44.38 
 
 
165 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  43.5 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  42.05 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  41.48 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  44.89 
 
 
166 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.78 
 
 
172 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  43.18 
 
 
166 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  41.57 
 
 
166 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  43.82 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  44.32 
 
 
166 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  43.75 
 
 
164 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  43.26 
 
 
165 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  43.18 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  41.81 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  43.18 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  43.5 
 
 
165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  47.62 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  41.01 
 
 
166 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  41.01 
 
 
166 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  44.91 
 
 
168 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  45.51 
 
 
168 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  42.94 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  44.64 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  43.98 
 
 
166 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  42.35 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  42.69 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  46.89 
 
 
163 aa  124  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  39.77 
 
 
166 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  42.69 
 
 
164 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  41.48 
 
 
184 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  38.6 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  38.37 
 
 
168 aa  119  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  41.1 
 
 
167 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  38.64 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  38.55 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  40.22 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  45.61 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  37.36 
 
 
202 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  36.52 
 
 
166 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  34.83 
 
 
228 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  34.97 
 
 
263 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  36.07 
 
 
183 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  35.91 
 
 
202 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  36.07 
 
 
183 aa  104  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  36.07 
 
 
183 aa  104  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  36.46 
 
 
191 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  35.91 
 
 
190 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  35.52 
 
 
196 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  37.99 
 
 
191 aa  100  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  35.75 
 
 
191 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  35.52 
 
 
191 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  38.07 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  34.59 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  32.96 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  34.08 
 
 
202 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  35.75 
 
 
200 aa  97.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  35.36 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  35.63 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  36.07 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  31.67 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  34.83 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  34.07 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  35.2 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  33.91 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  35.06 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  32.79 
 
 
195 aa  94.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  36.11 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  36 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  39.52 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  34.48 
 
 
178 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  34.25 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  32.79 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  33.52 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  32.22 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  36.26 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>