30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1584 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  100 
 
 		 356 aa  688    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  41.37 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.241974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  36.16 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  38.76 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  35.39 
 
 		 361 aa  185  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  36.64 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  37.02 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  36.74 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  37.43 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  32.8 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  36.51 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  40 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  28.31 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  26.77 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  28.68 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  29.41 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  29.02 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  24.66 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.57 
 
 		 1868 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0945  ATPase  27.06 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  24.53 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  25.24 
 
 		 463 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  26.14 
 
 		 476 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  30.29 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  28.78 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  29.55 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  29.92 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  29.32 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  23.71 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  23.85 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>