97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1550 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1550  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 428 aa  863    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1534  extracellular solute-binding protein  51.13 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1583  extracellular solute-binding protein  51.13 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0672  extracellular solute-binding protein family 1  38.48 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5385  extracellular solute-binding protein family 1  38.29 
 
 		 424 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.832628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0173  extracellular solute-binding protein family 1  35.5 
 
 		 443 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1713  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1705  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.72 
 
 		 283 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1976  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.51 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5703  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  31.91 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 336 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.09 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.8 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1454  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.08 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.13 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.35 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  20.53 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  20.46 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  38.46 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.2 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  41.82 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.22 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.76 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.76 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  45.1 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.76 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3940  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  45.1 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0082  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.82 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.23 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.76 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.87 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0882  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.37 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.76 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.77 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.82 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.07 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  31.82 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  20.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  20.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.77 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  42 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.5 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 420 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1850  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954804  decreased coverage  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 342 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>