120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1491 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1491  BioY protein  100 
 
 
220 aa  413  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.865608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  39.16 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  41.75 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  38.71 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  45.08 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  50 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  50 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  47.44 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.76 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  33.01 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  43.88 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  37.86 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  32.14 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  34.29 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  30.56 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  40.4 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  44.94 
 
 
179 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  44.87 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  42.2 
 
 
192 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  45.78 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  40.45 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  40.45 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  43.59 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.61 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  42.5 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  43.88 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  40.21 
 
 
187 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  36.36 
 
 
182 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  44.05 
 
 
187 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  44.58 
 
 
178 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.93 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  38.05 
 
 
184 aa  58.2  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  45 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  43.14 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  44 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  39.53 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  44 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  41.28 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  44 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  40 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  50.72 
 
 
180 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  42.22 
 
 
182 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  40.22 
 
 
179 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  37.14 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  31.53 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  35.71 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  33.33 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  45.78 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  31.53 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  36.63 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.06 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  32.56 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  31.53 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  34.51 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  30.63 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  53.16 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  30.63 
 
 
197 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  46.15 
 
 
191 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  33.91 
 
 
187 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  30.63 
 
 
197 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  30.63 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  30.63 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  30.63 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  34.94 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  40 
 
 
169 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  38.36 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  30.63 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  37.04 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  39.64 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  38.02 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  33.59 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  32.99 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  37.18 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  35.71 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  35.71 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  35.71 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  30.28 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  37.18 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  30.28 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  32 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  32 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  31.5 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.3 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  33.33 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  35.71 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  46.67 
 
 
191 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  35.11 
 
 
203 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  45.95 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  44.05 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  44.05 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  44.05 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  34.52 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  39.8 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  36.73 
 
 
201 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  33.33 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  34.88 
 
 
197 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  38.54 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  31 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  35.38 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  25.74 
 
 
182 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>