More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1486 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  716    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  51.59 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  50 
 
 		 342 aa  328  8e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.37 
 
 		 353 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  46.41 
 
 		 353 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  48.88 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.72 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  48.6 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  52.85 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  50.29 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.49 
 
 		 359 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.77 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  47.88 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.73 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  46.39 
 
 		 353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  49.69 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.14 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.57 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.22 
 
 		 352 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.27 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  50.32 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  45.87 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  49.44 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  46.52 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 		 353 aa  298  8e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 352 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  45.63 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  45.25 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  43.02 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  44.87 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  44.85 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  44.25 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  45.25 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  44.94 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  47.67 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  44.51 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  48.18 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 380 aa  292  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.76 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.15 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  43.26 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  44.51 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.6 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  45.86 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  42.94 
 
 		 329 aa  289  6e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.71 
 
 		 353 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 384 aa  289  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 374 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  45.62 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.32 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.69 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  43.77 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  46.24 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  44.31 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  44.29 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.07 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  42.82 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.09 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  41.46 
 
 		 353 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  43.78 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  43.79 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.97 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 395 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.76 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  41.74 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.14 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  43.82 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  44.19 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  53.04 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  47.49 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 		 364 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.16 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  42.35 
 
 		 357 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.18 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  42.86 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.9 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.18 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  41.06 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.94 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.66 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  43.26 
 
 		 358 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  43.89 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  42.21 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.74 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>