208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1354 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 566 aa  1095    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  30.38 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  31.48 
 
 		 799 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.5 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.64 
 
 		 763 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.43 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  27.25 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  28.28 
 
 		 750 aa  102  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.51 
 
 		 775 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 729 aa  95.9  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  25.96 
 
 		 741 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 		 854 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  26.68 
 
 		 548 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  30.15 
 
 		 850 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.62 
 
 		 764 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  28.07 
 
 		 750 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.09 
 
 		 729 aa  88.2  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.87 
 
 		 737 aa  87.4  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  27.13 
 
 		 854 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  30.71 
 
 		 883 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  29.18 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.35 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  28.91 
 
 		 762 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.96 
 
 		 962 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.07 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.07 
 
 		 733 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  31.23 
 
 		 857 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  28.17 
 
 		 917 aa  81.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  29.56 
 
 		 899 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  22.13 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  26.28 
 
 		 907 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.52 
 
 		 885 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  27.73 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  26.58 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  27.53 
 
 		 904 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  25.78 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25.21 
 
 		 744 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  29.89 
 
 		 859 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  28.76 
 
 		 892 aa  77  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  23.43 
 
 		 804 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  24.81 
 
 		 804 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  29.53 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  26.08 
 
 		 888 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.14 
 
 		 892 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.51 
 
 		 920 aa  75.5  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  25.36 
 
 		 823 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  28.14 
 
 		 933 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.38 
 
 		 885 aa  75.5  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  26.53 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 651 aa  73.9  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.48 
 
 		 800 aa  73.9  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  25.47 
 
 		 888 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.39 
 
 		 868 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  25.54 
 
 		 888 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  26.06 
 
 		 837 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  28.02 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  26.5 
 
 		 860 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 887 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  20.12 
 
 		 800 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  28.37 
 
 		 905 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  23.82 
 
 		 721 aa  70.5  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.33 
 
 		 970 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  27.08 
 
 		 832 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  32.22 
 
 		 944 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 781 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  22.45 
 
 		 778 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  23.27 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  21.83 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  28.2 
 
 		 871 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  42 
 
 		 929 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.77 
 
 		 724 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  24.33 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  27.79 
 
 		 901 aa  67.4  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  44.21 
 
 		 873 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  22.66 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  28.61 
 
 		 871 aa  67  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  27.98 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0997  CRISPR-associated helicase Cas3  25.36 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  0.0349281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  27.79 
 
 		 897 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.25 
 
 		 971 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.28 
 
 		 1540 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 		 912 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  25.59 
 
 		 887 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 		 905 aa  64.7  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  36.88 
 
 		 828 aa  64.3  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.14 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  30.25 
 
 		 843 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  42.99 
 
 		 943 aa  64.3  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  39.39 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  21.22 
 
 		 822 aa  63.9  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  24.57 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  19.33 
 
 		 772 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  25.79 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  26.33 
 
 		 879 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 		 887 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  25.75 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  25.85 
 
 		 899 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>