More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1199 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 423 aa  849    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  31.42 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  31.35 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  35.02 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  30.54 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 380 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.68 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.56 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.69 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.54 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  33.52 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  32.65 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.41 
 
 		 384 aa  94.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 362 aa  94  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.31 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  25.28 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  32.72 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.85 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  32.17 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  23.38 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.28 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 384 aa  87  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.82 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.93 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.66 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.96 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  30.14 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  31.88 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.59 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.57 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  29.98 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.29 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.33 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  30.74 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.35 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.87 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.56 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  26.01 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>