15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1130 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1130  ATPase  100 
 
 		 421 aa  842    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1207  ATPase  34.64 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0496  hypothetical protein  37.05 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1105  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  22.47 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  24.4 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  23.51 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.28 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  26.91 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  24.94 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.33 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  21.9 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  24.39 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  23.39 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  25.44 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>