271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0958 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  100 
 
 
629 aa  1255    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.77 
 
 
655 aa  192  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  30.63 
 
 
754 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  30.61 
 
 
650 aa  189  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  30.2 
 
 
650 aa  187  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  32.91 
 
 
622 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  32.27 
 
 
622 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  32.97 
 
 
619 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  28.94 
 
 
643 aa  179  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  33.19 
 
 
609 aa  174  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  32.26 
 
 
651 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  30.89 
 
 
633 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.97 
 
 
464 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  30.75 
 
 
797 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  31.02 
 
 
633 aa  167  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.2 
 
 
635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  30.65 
 
 
633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  30.68 
 
 
611 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.09 
 
 
716 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.92 
 
 
1090 aa  157  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.67 
 
 
636 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.17 
 
 
902 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.67 
 
 
466 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.82 
 
 
632 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.41 
 
 
633 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.65 
 
 
748 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.14 
 
 
636 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.01 
 
 
1048 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.75 
 
 
1077 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.08 
 
 
715 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  29.1 
 
 
479 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  28.37 
 
 
952 aa  140  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  29.18 
 
 
686 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.57 
 
 
1999 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  29.64 
 
 
769 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.5 
 
 
759 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.75 
 
 
759 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  27.74 
 
 
769 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.5 
 
 
759 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  28.96 
 
 
759 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.5 
 
 
759 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  28.96 
 
 
759 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  29.19 
 
 
759 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.69 
 
 
606 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  29.19 
 
 
759 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.77 
 
 
1099 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  27.12 
 
 
759 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.05 
 
 
2245 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  32.54 
 
 
934 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.44 
 
 
902 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  33.7 
 
 
901 aa  124  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.56 
 
 
986 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.19 
 
 
1428 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  29.02 
 
 
585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.38 
 
 
1097 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.57 
 
 
388 aa  114  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  32.73 
 
 
268 aa  113  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  30.29 
 
 
659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.16 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30 
 
 
752 aa  111  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.69 
 
 
1038 aa  111  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  31.17 
 
 
1189 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.83 
 
 
1653 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  29.39 
 
 
925 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.76 
 
 
795 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.35 
 
 
1408 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  32.7 
 
 
1116 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  29.17 
 
 
922 aa  104  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.97 
 
 
1126 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.05 
 
 
932 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  27.41 
 
 
553 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  27.41 
 
 
553 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  32.95 
 
 
928 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  29.41 
 
 
916 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  29.66 
 
 
237 aa  97.8  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  32.02 
 
 
1041 aa  97.8  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.72 
 
 
1261 aa  97.8  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  27.18 
 
 
941 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  30.69 
 
 
315 aa  94.4  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.92 
 
 
1620 aa  94  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  25.55 
 
 
1457 aa  94  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.75 
 
 
1018 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 
1651 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.54 
 
 
1363 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  26.15 
 
 
1427 aa  90.9  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.8 
 
 
946 aa  87.4  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  25.05 
 
 
1136 aa  87.4  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  30.36 
 
 
1585 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  30.36 
 
 
1585 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.11 
 
 
1823 aa  87.4  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  28.06 
 
 
1126 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  31.18 
 
 
1118 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  27.27 
 
 
283 aa  85.9  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.63 
 
 
1172 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  29.05 
 
 
1328 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  25.4 
 
 
1403 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  28.85 
 
 
914 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 
1178 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  31.79 
 
 
903 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.61 
 
 
521 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>