More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0935 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  746    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 500 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 500 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 496 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 492 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.61 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  27.82 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.1 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  29.92 
 
 		 417 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.73 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.18 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.43 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 816 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  30.42 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 816 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.77 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.87 
 
 		 417 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.17 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.58 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  28.61 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.32 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.56 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.06 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3774  sarcosine oxidase beta subunit  28.27 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.25 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 806 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  27.65 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  27.65 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.97 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.64 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.61 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.97 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.92 
 
 		 423 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.99 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 819 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 823 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.38 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.48 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.53 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.5 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  25.47 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  25.47 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  25.47 
 
 		 442 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.46 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  30.03 
 
 		 416 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 442 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.92 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.61 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  25.47 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  24.61 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  29.77 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.35 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.7 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.3 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.53 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>