More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0902 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
474 aa  970    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
470 aa  546  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
465 aa  508  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
478 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
484 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
478 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
466 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
475 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
474 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
500 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
476 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
479 aa  415  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
469 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
493 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
468 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
499 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
470 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
466 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
466 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
468 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
453 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
455 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
472 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
487 aa  395  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
459 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
459 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
459 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
493 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
481 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
459 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
459 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
461 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
501 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
466 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
459 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
461 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
461 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
461 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
485 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
459 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
487 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
479 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
459 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
461 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
459 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
459 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
461 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
461 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
469 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
465 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
481 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
465 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
461 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
476 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
459 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
458 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
460 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
473 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
461 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
460 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
465 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
460 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0065  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
476 aa  378  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
459 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
465 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
493 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
469 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
461 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
485 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
485 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
458 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
461 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
461 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
465 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
456 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
456 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
498 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
457 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
480 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
461 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
462 aa  372  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
474 aa  372  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
460 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
466 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
474 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
480 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>