More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0885 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  100 
 
 
631 aa  1279    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  47.7 
 
 
610 aa  546  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  47.16 
 
 
604 aa  538  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  46.6 
 
 
602 aa  532  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  47.44 
 
 
604 aa  528  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  49.49 
 
 
596 aa  527  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  36.53 
 
 
780 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  36.75 
 
 
855 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  35.73 
 
 
702 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  35.71 
 
 
868 aa  304  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  32.72 
 
 
744 aa  300  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  31.73 
 
 
743 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  33.61 
 
 
931 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  32.14 
 
 
843 aa  295  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  32.43 
 
 
827 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  33.33 
 
 
641 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.76 
 
 
849 aa  292  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  32.75 
 
 
771 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  33.22 
 
 
844 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.83 
 
 
837 aa  291  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  33.45 
 
 
931 aa  289  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  33.5 
 
 
942 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.7 
 
 
837 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  30.91 
 
 
834 aa  279  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.03 
 
 
864 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  31.5 
 
 
863 aa  277  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  32.58 
 
 
747 aa  276  6e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  32.18 
 
 
616 aa  276  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  31.69 
 
 
863 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.32 
 
 
938 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  32.89 
 
 
935 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  31.18 
 
 
1009 aa  254  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  31.06 
 
 
629 aa  253  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  30.02 
 
 
828 aa  248  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 
668 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  25.48 
 
 
814 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  25.3 
 
 
812 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  23.77 
 
 
853 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  24.42 
 
 
814 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3867  DNA topoisomerase I  27.54 
 
 
720 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.442129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  26 
 
 
620 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2482  DNA topoisomerase I  27.31 
 
 
720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0421727 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 
691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 
691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  28.18 
 
 
768 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  25.69 
 
 
706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  23.61 
 
 
817 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  25.32 
 
 
691 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  28.28 
 
 
697 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.1 
 
 
694 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  26.02 
 
 
873 aa  157  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  26.28 
 
 
700 aa  156  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  27.68 
 
 
691 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  27.13 
 
 
696 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  26.56 
 
 
695 aa  155  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  26.68 
 
 
693 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  25.91 
 
 
653 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  25.79 
 
 
700 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  26.72 
 
 
704 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  26.22 
 
 
652 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  25.95 
 
 
700 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  26.21 
 
 
650 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 
697 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  25.23 
 
 
872 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2478  DNA topoisomerase III  26.07 
 
 
662 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  26.96 
 
 
702 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  26.47 
 
 
679 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  26.93 
 
 
686 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  26.03 
 
 
654 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  26.95 
 
 
680 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  25.86 
 
 
669 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  25.42 
 
 
669 aa  152  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  22.94 
 
 
694 aa  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 
868 aa  151  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 
898 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  25.75 
 
 
653 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  26.28 
 
 
714 aa  150  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 
895 aa  150  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 
804 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  25.99 
 
 
857 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  25.99 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  25.29 
 
 
696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  26.04 
 
 
880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  30.62 
 
 
681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  25.71 
 
 
765 aa  148  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  27.03 
 
 
718 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  24.82 
 
 
700 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  27.8 
 
 
868 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  27.47 
 
 
894 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  25.53 
 
 
896 aa  147  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  25.77 
 
 
851 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  26.64 
 
 
689 aa  147  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  27.8 
 
 
872 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  25.09 
 
 
700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1050  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 
726 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0690587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  25.08 
 
 
697 aa  147  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  25.64 
 
 
880 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  24.92 
 
 
714 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  25.64 
 
 
880 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  25.7 
 
 
889 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>