84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0743 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  100 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  56.65 
 
 		 358 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  48.07 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  46.53 
 
 		 333 aa  194  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  46.28 
 
 		 330 aa  192  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  46.12 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  45.69 
 
 		 358 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  41.38 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  41.74 
 
 		 324 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  41.67 
 
 		 324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  41.3 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  41.88 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  39.59 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  37.08 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  39.75 
 
 		 324 aa  141  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  40.77 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  40.64 
 
 		 658 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  38.52 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  36.73 
 
 		 322 aa  134  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  39.33 
 
 		 407 aa  131  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  35.51 
 
 		 322 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  36.33 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  35.1 
 
 		 322 aa  129  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  36.33 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  34.29 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  34.29 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  35.04 
 
 		 325 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  36.72 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  37.3 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  34.8 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  35.8 
 
 		 323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  34.41 
 
 		 343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  33.46 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  32.94 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  32.91 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  31.95 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  35.68 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  34.5 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  32.54 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  31.08 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  34.65 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  31.33 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  31.75 
 
 		 311 aa  78.6  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  34.33 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  34.04 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  29.26 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  31.63 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.61 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  31.12 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  30.61 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  48.65 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  40.31 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  27.57 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  33.33 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  29.74 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  31 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  33.47 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  29.94 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  25.11 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  32.74 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  31.82 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  26.15 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  31.16 
 
 		 541 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  32.37 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  39.74 
 
 		 456 aa  52  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  24.9 
 
 		 288 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  32.35 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  27.14 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  29.59 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  27.83 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  32.12 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  26.84 
 
 		 598 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  29.79 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  52.5 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  35.23 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  47.62 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  35.09 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  38.1 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  44.23 
 
 		 494 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  30.24 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  31.3 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  33.67 
 
 		 508 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>